Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
FBXO40Q9UH90 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
FBXO40Q9UH90 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
FBXO40Q9UH90 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
FBXO40Q9UH90 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.79■■■□□ 2.52
FBXO40Q9UH90 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FBXO40Q9UH90 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
FBXO40Q9UH90 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
FBXO40Q9UH90 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
FBXO40Q9UH90 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
FBXO40Q9UH90 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
FBXO40Q9UH90 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
FBXO40Q9UH90 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
FBXO40Q9UH90 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FBXO40Q9UH90 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FBXO40Q9UH90 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
FBXO40Q9UH90 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
FBXO40Q9UH90 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
FBXO40Q9UH90 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
FBXO40Q9UH90 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
FBXO40Q9UH90 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FBXO40Q9UH90 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
FBXO40Q9UH90 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
FBXO40Q9UH90 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms