Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ChmlQ9QZD5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ChmlQ9QZD5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ChmlQ9QZD5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ChmlQ9QZD5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ChmlQ9QZD5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ChmlQ9QZD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms