Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC1

Pcnx1, Pecanex-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcnx1Q9QYC1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcnx1Q9QYC1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms