Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYC1

Pcnx1, Pecanex-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcnx1Q9QYC1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pcnx1Q9QYC1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pcnx1Q9QYC1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pcnx1Q9QYC1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pcnx1Q9QYC1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pcnx1Q9QYC1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pcnx1Q9QYC1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pcnx1Q9QYC1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcnx1Q9QYC1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcnx1Q9QYC1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms