Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX98

Ptf1a, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptf1aQ9QX98 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ptf1aQ9QX98 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ptf1aQ9QX98 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Ptf1aQ9QX98 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ptf1aQ9QX98 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ptf1aQ9QX98 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ptf1aQ9QX98 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ptf1aQ9QX98 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ptf1aQ9QX98 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ptf1aQ9QX98 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ptf1aQ9QX98 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ptf1aQ9QX98 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ptf1aQ9QX98 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ptf1aQ9QX98 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ptf1aQ9QX98 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ptf1aQ9QX98 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ptf1aQ9QX98 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ptf1aQ9QX98 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ptf1aQ9QX98 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ptf1aQ9QX98 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Ptf1aQ9QX98 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ptf1aQ9QX98 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ptf1aQ9QX98 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ptf1aQ9QX98 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ptf1aQ9QX98 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ptf1aQ9QX98 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ptf1aQ9QX98 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ptf1aQ9QX98 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Ptf1aQ9QX98 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ptf1aQ9QX98 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ptf1aQ9QX98 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ptf1aQ9QX98 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Ptf1aQ9QX98 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ptf1aQ9QX98 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Ptf1aQ9QX98 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Ptf1aQ9QX98 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Ptf1aQ9QX98 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Ptf1aQ9QX98 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ptf1aQ9QX98 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Ptf1aQ9QX98 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Ptf1aQ9QX98 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Ptf1aQ9QX98 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ptf1aQ9QX98 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Ptf1aQ9QX98 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Ptf1aQ9QX98 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Ptf1aQ9QX98 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
Ptf1aQ9QX98 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ptf1aQ9QX98 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms