Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2Q2

FRMD4A, FERM domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD4AQ9P2Q2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FRMD4AQ9P2Q2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.61■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FRMD4AQ9P2Q2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FRMD4AQ9P2Q2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMD4AQ9P2Q2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMD4AQ9P2Q2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMD4AQ9P2Q2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FRMD4AQ9P2Q2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FRMD4AQ9P2Q2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMD4AQ9P2Q2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FRMD4AQ9P2Q2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
FRMD4AQ9P2Q2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FRMD4AQ9P2Q2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FRMD4AQ9P2Q2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
FRMD4AQ9P2Q2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FRMD4AQ9P2Q2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
FRMD4AQ9P2Q2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMD4AQ9P2Q2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
FRMD4AQ9P2Q2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FRMD4AQ9P2Q2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMD4AQ9P2Q2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FRMD4AQ9P2Q2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FRMD4AQ9P2Q2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
FRMD4AQ9P2Q2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FRMD4AQ9P2Q2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FRMD4AQ9P2Q2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FRMD4AQ9P2Q2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
FRMD4AQ9P2Q2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms