Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrfQ9JM73 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SrfQ9JM73 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SrfQ9JM73 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrfQ9JM73 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SrfQ9JM73 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SrfQ9JM73 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SrfQ9JM73 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SrfQ9JM73 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SrfQ9JM73 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrfQ9JM73 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SrfQ9JM73 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SrfQ9JM73 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrfQ9JM73 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SrfQ9JM73 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SrfQ9JM73 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrfQ9JM73 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrfQ9JM73 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SrfQ9JM73 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SrfQ9JM73 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SrfQ9JM73 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SrfQ9JM73 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrfQ9JM73 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SrfQ9JM73 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrfQ9JM73 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SrfQ9JM73 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SrfQ9JM73 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SrfQ9JM73 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SrfQ9JM73 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SrfQ9JM73 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SrfQ9JM73 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrfQ9JM73 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrfQ9JM73 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SrfQ9JM73 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrfQ9JM73 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SrfQ9JM73 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SrfQ9JM73 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrfQ9JM73 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrfQ9JM73 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SrfQ9JM73 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SrfQ9JM73 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SrfQ9JM73 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SrfQ9JM73 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SrfQ9JM73 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrfQ9JM73 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SrfQ9JM73 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SrfQ9JM73 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms