Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL19

Ncoa6, Nuclear receptor coactivator 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa6Q9JL19 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ncoa6Q9JL19 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ncoa6Q9JL19 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ncoa6Q9JL19 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ncoa6Q9JL19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms