Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL19

Ncoa6, Nuclear receptor coactivator 6, mousemouse

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Length 2,067 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa6Q9JL19 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ncoa6Q9JL19 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ncoa6Q9JL19 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ncoa6Q9JL19 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ncoa6Q9JL19 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ncoa6Q9JL19 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ncoa6Q9JL19 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ncoa6Q9JL19 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ncoa6Q9JL19 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ncoa6Q9JL19 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ncoa6Q9JL19 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ncoa6Q9JL19 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms