Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIN6

Kcnmb4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnmb4Q9JIN6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kcnmb4Q9JIN6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kcnmb4Q9JIN6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kcnmb4Q9JIN6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Kcnmb4Q9JIN6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Kcnmb4Q9JIN6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Kcnmb4Q9JIN6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Kcnmb4Q9JIN6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kcnmb4Q9JIN6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms