Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAH1

ZNF556, Zinc finger protein 556, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF556Q9HAH1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF556Q9HAH1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF556Q9HAH1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF556Q9HAH1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF556Q9HAH1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF556Q9HAH1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF556Q9HAH1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms