Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB8

PPCS, Phosphopantothenate--cysteine ligase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPCSQ9HAB8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PPCSQ9HAB8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPCSQ9HAB8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPCSQ9HAB8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPCSQ9HAB8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PPCSQ9HAB8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPCSQ9HAB8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPCSQ9HAB8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPCSQ9HAB8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPCSQ9HAB8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPCSQ9HAB8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PPCSQ9HAB8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPCSQ9HAB8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPCSQ9HAB8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPCSQ9HAB8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPCSQ9HAB8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPCSQ9HAB8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPCSQ9HAB8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPCSQ9HAB8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPCSQ9HAB8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPCSQ9HAB8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPCSQ9HAB8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PPCSQ9HAB8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PPCSQ9HAB8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PPCSQ9HAB8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PPCSQ9HAB8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms