Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET77

Jph3, Junctophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jph3Q9ET77 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jph3Q9ET77 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jph3Q9ET77 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Jph3Q9ET77 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Jph3Q9ET77 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Jph3Q9ET77 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Jph3Q9ET77 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Jph3Q9ET77 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Jph3Q9ET77 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jph3Q9ET77 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Jph3Q9ET77 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Jph3Q9ET77 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jph3Q9ET77 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Jph3Q9ET77 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Jph3Q9ET77 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Jph3Q9ET77 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jph3Q9ET77 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Jph3Q9ET77 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Jph3Q9ET77 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Jph3Q9ET77 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Jph3Q9ET77 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jph3Q9ET77 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Jph3Q9ET77 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Jph3Q9ET77 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Jph3Q9ET77 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Jph3Q9ET77 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Jph3Q9ET77 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Jph3Q9ET77 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Jph3Q9ET77 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Jph3Q9ET77 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Jph3Q9ET77 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Jph3Q9ET77 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Jph3Q9ET77 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Jph3Q9ET77 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Jph3Q9ET77 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Jph3Q9ET77 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jph3Q9ET77 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jph3Q9ET77 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jph3Q9ET77 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Jph3Q9ET77 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Jph3Q9ET77 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Jph3Q9ET77 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Jph3Q9ET77 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Jph3Q9ET77 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Jph3Q9ET77 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Jph3Q9ET77 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms