Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL5

Mmp1a, Interstitial collagenase A, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1aQ9EPL5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mmp1aQ9EPL5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp1aQ9EPL5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mmp1aQ9EPL5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp1aQ9EPL5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp1aQ9EPL5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mmp1aQ9EPL5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mmp1aQ9EPL5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mmp1aQ9EPL5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mmp1aQ9EPL5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp1aQ9EPL5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp1aQ9EPL5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp1aQ9EPL5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mmp1aQ9EPL5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp1aQ9EPL5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mmp1aQ9EPL5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mmp1aQ9EPL5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp1aQ9EPL5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mmp1aQ9EPL5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mmp1aQ9EPL5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mmp1aQ9EPL5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mmp1aQ9EPL5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp1aQ9EPL5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mmp1aQ9EPL5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms