Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM2

Ehhadh, Peroxisomal bifunctional enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EhhadhQ9DBM2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
EhhadhQ9DBM2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
EhhadhQ9DBM2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
EhhadhQ9DBM2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EhhadhQ9DBM2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
EhhadhQ9DBM2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
EhhadhQ9DBM2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
EhhadhQ9DBM2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
EhhadhQ9DBM2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EhhadhQ9DBM2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
EhhadhQ9DBM2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
EhhadhQ9DBM2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EhhadhQ9DBM2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EhhadhQ9DBM2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
EhhadhQ9DBM2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
EhhadhQ9DBM2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
EhhadhQ9DBM2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
EhhadhQ9DBM2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EhhadhQ9DBM2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
EhhadhQ9DBM2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
EhhadhQ9DBM2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
EhhadhQ9DBM2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EhhadhQ9DBM2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
EhhadhQ9DBM2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
EhhadhQ9DBM2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
EhhadhQ9DBM2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
EhhadhQ9DBM2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EhhadhQ9DBM2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
EhhadhQ9DBM2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EhhadhQ9DBM2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EhhadhQ9DBM2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
EhhadhQ9DBM2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
EhhadhQ9DBM2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
EhhadhQ9DBM2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
EhhadhQ9DBM2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
EhhadhQ9DBM2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
EhhadhQ9DBM2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
EhhadhQ9DBM2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
EhhadhQ9DBM2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EhhadhQ9DBM2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EhhadhQ9DBM2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EhhadhQ9DBM2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
EhhadhQ9DBM2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
EhhadhQ9DBM2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
EhhadhQ9DBM2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
EhhadhQ9DBM2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
EhhadhQ9DBM2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
EhhadhQ9DBM2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
EhhadhQ9DBM2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
EhhadhQ9DBM2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EhhadhQ9DBM2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
EhhadhQ9DBM2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms