Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9G2

Pebp4, Phosphatidylethanolamine-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pebp4Q9D9G2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pebp4Q9D9G2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pebp4Q9D9G2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pebp4Q9D9G2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pebp4Q9D9G2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pebp4Q9D9G2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Pebp4Q9D9G2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pebp4Q9D9G2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pebp4Q9D9G2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pebp4Q9D9G2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pebp4Q9D9G2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pebp4Q9D9G2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pebp4Q9D9G2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pebp4Q9D9G2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pebp4Q9D9G2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pebp4Q9D9G2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms