Protein–RNA interactions for Protein: Q9D479

Uvssa, UV-stimulated scaffold protein A, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UvssaQ9D479 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
UvssaQ9D479 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UvssaQ9D479 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
UvssaQ9D479 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UvssaQ9D479 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
UvssaQ9D479 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UvssaQ9D479 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UvssaQ9D479 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
UvssaQ9D479 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UvssaQ9D479 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UvssaQ9D479 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UvssaQ9D479 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UvssaQ9D479 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UvssaQ9D479 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UvssaQ9D479 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UvssaQ9D479 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
UvssaQ9D479 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UvssaQ9D479 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
UvssaQ9D479 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
UvssaQ9D479 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
UvssaQ9D479 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
UvssaQ9D479 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
UvssaQ9D479 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
UvssaQ9D479 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
UvssaQ9D479 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
UvssaQ9D479 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
UvssaQ9D479 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UvssaQ9D479 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
UvssaQ9D479 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UvssaQ9D479 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
UvssaQ9D479 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
UvssaQ9D479 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
UvssaQ9D479 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
UvssaQ9D479 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
UvssaQ9D479 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC30.5■■■□□ 2.47
UvssaQ9D479 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
UvssaQ9D479 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UvssaQ9D479 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UvssaQ9D479 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UvssaQ9D479 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
UvssaQ9D479 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
UvssaQ9D479 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
UvssaQ9D479 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UvssaQ9D479 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
UvssaQ9D479 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
UvssaQ9D479 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
UvssaQ9D479 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UvssaQ9D479 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
UvssaQ9D479 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
UvssaQ9D479 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
UvssaQ9D479 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
UvssaQ9D479 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UvssaQ9D479 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
UvssaQ9D479 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
UvssaQ9D479 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
UvssaQ9D479 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
UvssaQ9D479 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UvssaQ9D479 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
UvssaQ9D479 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
UvssaQ9D479 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
UvssaQ9D479 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
UvssaQ9D479 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
UvssaQ9D479 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UvssaQ9D479 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
UvssaQ9D479 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UvssaQ9D479 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
UvssaQ9D479 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UvssaQ9D479 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
UvssaQ9D479 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
UvssaQ9D479 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
UvssaQ9D479 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC30.17■■■□□ 2.42
UvssaQ9D479 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
UvssaQ9D479 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
UvssaQ9D479 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
UvssaQ9D479 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
UvssaQ9D479 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
UvssaQ9D479 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
UvssaQ9D479 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms