Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Sppl3Q9CUS9 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Sppl3Q9CUS9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sppl3Q9CUS9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Sppl3Q9CUS9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sppl3Q9CUS9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sppl3Q9CUS9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sppl3Q9CUS9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Sppl3Q9CUS9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Sppl3Q9CUS9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Sppl3Q9CUS9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sppl3Q9CUS9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Sppl3Q9CUS9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Sppl3Q9CUS9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sppl3Q9CUS9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Sppl3Q9CUS9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Sppl3Q9CUS9 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Sppl3Q9CUS9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sppl3Q9CUS9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Sppl3Q9CUS9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Sppl3Q9CUS9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Sppl3Q9CUS9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Sppl3Q9CUS9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Sppl3Q9CUS9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Sppl3Q9CUS9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Sppl3Q9CUS9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sppl3Q9CUS9 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sppl3Q9CUS9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sppl3Q9CUS9 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms