Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GpnmbQ99P91 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GpnmbQ99P91 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GpnmbQ99P91 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GpnmbQ99P91 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GpnmbQ99P91 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
GpnmbQ99P91 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GpnmbQ99P91 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GpnmbQ99P91 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms