Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atoh8Q99NA2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Atoh8Q99NA2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atoh8Q99NA2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atoh8Q99NA2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Atoh8Q99NA2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Atoh8Q99NA2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Atoh8Q99NA2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atoh8Q99NA2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Atoh8Q99NA2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atoh8Q99NA2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atoh8Q99NA2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Atoh8Q99NA2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atoh8Q99NA2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Atoh8Q99NA2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Atoh8Q99NA2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Atoh8Q99NA2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atoh8Q99NA2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Atoh8Q99NA2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Atoh8Q99NA2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atoh8Q99NA2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atoh8Q99NA2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atoh8Q99NA2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atoh8Q99NA2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atoh8Q99NA2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atoh8Q99NA2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atoh8Q99NA2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atoh8Q99NA2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atoh8Q99NA2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Atoh8Q99NA2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atoh8Q99NA2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atoh8Q99NA2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Atoh8Q99NA2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atoh8Q99NA2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atoh8Q99NA2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atoh8Q99NA2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.3 ms