Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Sfxn1Q99JR1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
Sfxn1Q99JR1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Sfxn1Q99JR1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25,97■■□□□ 1,75
Sfxn1Q99JR1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Sfxn1Q99JR1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,9■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Sfxn1Q99JR1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,73
Sfxn1Q99JR1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Sfxn1Q99JR1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Sfxn1Q99JR1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25,88■■□□□ 1,73
Sfxn1Q99JR1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Sfxn1Q99JR1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Sfxn1Q99JR1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Sfxn1Q99JR1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25,86■■□□□ 1,73
Sfxn1Q99JR1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Sfxn1Q99JR1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Sfxn1Q99JR1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25,77■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Sfxn1Q99JR1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25,76■■□□□ 1,71
Sfxn1Q99JR1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Sfxn1Q99JR1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
Sfxn1Q99JR1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25,74■■□□□ 1,71
Sfxn1Q99JR1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Sfxn1Q99JR1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Sfxn1Q99JR1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25,72■■□□□ 1,71
Sfxn1Q99JR1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Sfxn1Q99JR1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Sfxn1Q99JR1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Sfxn1Q99JR1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,7■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25,66■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
Sfxn1Q99JR1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
Sfxn1Q99JR1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Sfxn1Q99JR1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25,62■■□□□ 1,69
Sfxn1Q99JR1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Sfxn1Q99JR1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Sfxn1Q99JR1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Sfxn1Q99JR1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Sfxn1Q99JR1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Sfxn1Q99JR1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Sfxn1Q99JR1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Sfxn1Q99JR1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Sfxn1Q99JR1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Sfxn1Q99JR1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Sfxn1Q99JR1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Sfxn1Q99JR1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Sfxn1Q99JR1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Sfxn1Q99JR1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Sfxn1Q99JR1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Sfxn1Q99JR1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Sfxn1Q99JR1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Sfxn1Q99JR1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Sfxn1Q99JR1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Sfxn1Q99JR1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25,49■■□□□ 1,67
Sfxn1Q99JR1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Sfxn1Q99JR1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Sfxn1Q99JR1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Sfxn1Q99JR1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25,46■■□□□ 1,67
Sfxn1Q99JR1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Sfxn1Q99JR1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Sfxn1Q99JR1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Sfxn1Q99JR1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Sfxn1Q99JR1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25,41■■□□□ 1,66
Sfxn1Q99JR1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Sfxn1Q99JR1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Sfxn1Q99JR1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Sfxn1Q99JR1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Sfxn1Q99JR1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Sfxn1Q99JR1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,2 ms