Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PRAM1Q96QH2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRAM1Q96QH2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRAM1Q96QH2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRAM1Q96QH2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PRAM1Q96QH2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRAM1Q96QH2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
PRAM1Q96QH2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PRAM1Q96QH2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PRAM1Q96QH2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRAM1Q96QH2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRAM1Q96QH2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRAM1Q96QH2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PRAM1Q96QH2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PRAM1Q96QH2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PRAM1Q96QH2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PRAM1Q96QH2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PRAM1Q96QH2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PRAM1Q96QH2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PRAM1Q96QH2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRAM1Q96QH2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PRAM1Q96QH2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRAM1Q96QH2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRAM1Q96QH2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PRAM1Q96QH2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PRAM1Q96QH2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRAM1Q96QH2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRAM1Q96QH2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
PRAM1Q96QH2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRAM1Q96QH2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PRAM1Q96QH2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PRAM1Q96QH2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
PRAM1Q96QH2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAM1Q96QH2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PRAM1Q96QH2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
PRAM1Q96QH2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PRAM1Q96QH2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
PRAM1Q96QH2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PRAM1Q96QH2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
PRAM1Q96QH2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
PRAM1Q96QH2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PRAM1Q96QH2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PRAM1Q96QH2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PRAM1Q96QH2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC37.31■■■■□ 3.56
PRAM1Q96QH2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
PRAM1Q96QH2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms