Protein–RNA interactions for Protein: Q96MV1

TMEM56, Transmembrane protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM56Q96MV1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM56Q96MV1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM56Q96MV1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TMEM56Q96MV1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TMEM56Q96MV1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TMEM56Q96MV1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM56Q96MV1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms