Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
CCDC136Q96JN2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
CCDC136Q96JN2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
CCDC136Q96JN2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC136Q96JN2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
CCDC136Q96JN2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC136Q96JN2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC136Q96JN2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CCDC136Q96JN2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC136Q96JN2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CCDC136Q96JN2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
CCDC136Q96JN2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
CCDC136Q96JN2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CCDC136Q96JN2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC136Q96JN2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
CCDC136Q96JN2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
CCDC136Q96JN2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC136Q96JN2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CCDC136Q96JN2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
CCDC136Q96JN2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC136Q96JN2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CCDC136Q96JN2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CCDC136Q96JN2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC136Q96JN2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CCDC136Q96JN2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
CCDC136Q96JN2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC136Q96JN2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC136Q96JN2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
CCDC136Q96JN2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
CCDC136Q96JN2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC136Q96JN2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
CCDC136Q96JN2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CCDC136Q96JN2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
CCDC136Q96JN2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CCDC136Q96JN2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC136Q96JN2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CCDC136Q96JN2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC136Q96JN2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
CCDC136Q96JN2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC136Q96JN2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CCDC136Q96JN2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CCDC136Q96JN2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC136Q96JN2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC136Q96JN2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CCDC136Q96JN2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CCDC136Q96JN2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms