Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
Clip1Q922J3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
Clip1Q922J3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Clip1Q922J3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC40.11■■■■■ 4.01
Clip1Q922J3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Clip1Q922J3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Clip1Q922J3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Clip1Q922J3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Clip1Q922J3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
Clip1Q922J3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Clip1Q922J3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Clip1Q922J3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC40.05■■■■■ 4
Clip1Q922J3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Clip1Q922J3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Clip1Q922J3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Clip1Q922J3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Clip1Q922J3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■□ 3.99
Clip1Q922J3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
Clip1Q922J3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
Clip1Q922J3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
Clip1Q922J3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39.96■■■■□ 3.99
Clip1Q922J3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
Clip1Q922J3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC39.93■■■■□ 3.98
Clip1Q922J3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
Clip1Q922J3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Clip1Q922J3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Clip1Q922J3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Clip1Q922J3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Clip1Q922J3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Clip1Q922J3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Clip1Q922J3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Clip1Q922J3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.85■■■■□ 3.97
Clip1Q922J3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Clip1Q922J3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.84■■■■□ 3.97
Clip1Q922J3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
Clip1Q922J3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.96
Clip1Q922J3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC39.82■■■■□ 3.96
Clip1Q922J3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Clip1Q922J3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
Clip1Q922J3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
Clip1Q922J3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
Clip1Q922J3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Clip1Q922J3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
Clip1Q922J3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
Clip1Q922J3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
Clip1Q922J3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
Clip1Q922J3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC39.74■■■■□ 3.95
Clip1Q922J3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Clip1Q922J3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Clip1Q922J3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Clip1Q922J3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC39.7■■■■□ 3.95
Clip1Q922J3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
Clip1Q922J3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Clip1Q922J3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Clip1Q922J3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
Clip1Q922J3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Clip1Q922J3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
Clip1Q922J3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
Clip1Q922J3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
Clip1Q922J3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.62■■■■□ 3.93
Clip1Q922J3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Clip1Q922J3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Clip1Q922J3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
Clip1Q922J3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
Clip1Q922J3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
Clip1Q922J3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Clip1Q922J3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
Clip1Q922J3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC39.54■■■■□ 3.92
Clip1Q922J3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
Clip1Q922J3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
Clip1Q922J3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
Clip1Q922J3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Clip1Q922J3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Clip1Q922J3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC39.49■■■■□ 3.91
Clip1Q922J3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
Clip1Q922J3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
Clip1Q922J3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Clip1Q922J3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Clip1Q922J3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
Clip1Q922J3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Clip1Q922J3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
Clip1Q922J3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
Clip1Q922J3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.89
Clip1Q922J3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
Clip1Q922J3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Clip1Q922J3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC39.36■■■■□ 3.89
Clip1Q922J3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
Clip1Q922J3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
Clip1Q922J3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
Clip1Q922J3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.88
Clip1Q922J3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
Clip1Q922J3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.31■■■■□ 3.88
Clip1Q922J3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
Clip1Q922J3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC39.3■■■■□ 3.88
Clip1Q922J3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC39.29■■■■□ 3.88
Clip1Q922J3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Clip1Q922J3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.29■■■■□ 3.88
Clip1Q922J3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.28■■■■□ 3.88
Clip1Q922J3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
Clip1Q922J3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.8 ms