Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,57
Trpm2Q91YD4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,57
Trpm2Q91YD4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,32■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37,31■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,31■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,3■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC37,28■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37,28■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,26■■■■□ 3,56
Trpm2Q91YD4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,24■■■■□ 3,55
Trpm2Q91YD4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC37,23■■■■□ 3,55
Trpm2Q91YD4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,22■■■■□ 3,55
Trpm2Q91YD4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Trpm2Q91YD4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Trpm2Q91YD4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC37,21■■■■□ 3,55
Trpm2Q91YD4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Trpm2Q91YD4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37,16■■■■□ 3,54
Trpm2Q91YD4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,15■■■■□ 3,54
Trpm2Q91YD4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,15■■■■□ 3,54
Trpm2Q91YD4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC37,14■■■■□ 3,54
Trpm2Q91YD4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Trpm2Q91YD4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,11■■■■□ 3,53
Trpm2Q91YD4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,1■■■■□ 3,53
Trpm2Q91YD4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37,1■■■■□ 3,53
Trpm2Q91YD4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC37,08■■■■□ 3,53
Trpm2Q91YD4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37,08■■■■□ 3,53
Trpm2Q91YD4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Trpm2Q91YD4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Trpm2Q91YD4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37,05■■■■□ 3,52
Trpm2Q91YD4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Trpm2Q91YD4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Trpm2Q91YD4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37,03■■■■□ 3,52
Trpm2Q91YD4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37,03■■■■□ 3,52
Trpm2Q91YD4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,99■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36,99■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36,98■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36,97■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Trpm2Q91YD4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Trpm2Q91YD4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC36,93■■■■□ 3,5
Trpm2Q91YD4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36,93■■■■□ 3,5
Trpm2Q91YD4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Trpm2Q91YD4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Trpm2Q91YD4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Trpm2Q91YD4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Trpm2Q91YD4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Trpm2Q91YD4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Trpm2Q91YD4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC36,89■■■■□ 3,5
Trpm2Q91YD4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC36,87■■■■□ 3,49
Trpm2Q91YD4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC36,87■■■■□ 3,49
Trpm2Q91YD4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,87■■■■□ 3,49
Trpm2Q91YD4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Trpm2Q91YD4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC36,83■■■■□ 3,49
Trpm2Q91YD4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Trpm2Q91YD4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,49
Trpm2Q91YD4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC36,81■■■■□ 3,48
Trpm2Q91YD4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,81■■■■□ 3,48
Trpm2Q91YD4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36,81■■■■□ 3,48
Trpm2Q91YD4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Trpm2Q91YD4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Trpm2Q91YD4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Trpm2Q91YD4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Trpm2Q91YD4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Trpm2Q91YD4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Trpm2Q91YD4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Trpm2Q91YD4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Trpm2Q91YD4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,75■■■■□ 3,47
Trpm2Q91YD4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC36,75■■■■□ 3,47
Trpm2Q91YD4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Trpm2Q91YD4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Trpm2Q91YD4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Trpm2Q91YD4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Trpm2Q91YD4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Trpm2Q91YD4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Trpm2Q91YD4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Trpm2Q91YD4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,62■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC36,59■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Trpm2Q91YD4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms