Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBM7

TMEM254, Transmembrane protein 254, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM254Q8TBM7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TMEM254Q8TBM7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TMEM254Q8TBM7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM254Q8TBM7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TMEM254Q8TBM7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms