Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCJ5

SPRYD3, SPRY domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRYD3Q8NCJ5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SPRYD3Q8NCJ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SPRYD3Q8NCJ5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SPRYD3Q8NCJ5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SPRYD3Q8NCJ5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SPRYD3Q8NCJ5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SPRYD3Q8NCJ5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SPRYD3Q8NCJ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SPRYD3Q8NCJ5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SPRYD3Q8NCJ5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
SPRYD3Q8NCJ5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SPRYD3Q8NCJ5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SPRYD3Q8NCJ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
SPRYD3Q8NCJ5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SPRYD3Q8NCJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
SPRYD3Q8NCJ5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SPRYD3Q8NCJ5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SPRYD3Q8NCJ5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SPRYD3Q8NCJ5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SPRYD3Q8NCJ5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SPRYD3Q8NCJ5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms