Protein–RNA interactions for Protein: Q8N239

KLHL34, Kelch-like protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL34Q8N239 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
KLHL34Q8N239 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
KLHL34Q8N239 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
KLHL34Q8N239 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
KLHL34Q8N239 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
KLHL34Q8N239 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
KLHL34Q8N239 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
KLHL34Q8N239 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.17■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
KLHL34Q8N239 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
KLHL34Q8N239 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KLHL34Q8N239 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
KLHL34Q8N239 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
KLHL34Q8N239 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
KLHL34Q8N239 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
KLHL34Q8N239 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
KLHL34Q8N239 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
KLHL34Q8N239 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
KLHL34Q8N239 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms