Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYP4X1Q8N118 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYP4X1Q8N118 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CYP4X1Q8N118 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
CYP4X1Q8N118 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CYP4X1Q8N118 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP4X1Q8N118 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CYP4X1Q8N118 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CYP4X1Q8N118 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP4X1Q8N118 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP4X1Q8N118 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP4X1Q8N118 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CYP4X1Q8N118 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP4X1Q8N118 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CYP4X1Q8N118 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CYP4X1Q8N118 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CYP4X1Q8N118 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP4X1Q8N118 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP4X1Q8N118 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CYP4X1Q8N118 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CYP4X1Q8N118 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms