Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rdh16f2Q8K3M1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rdh16f2Q8K3M1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh16f2Q8K3M1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh16f2Q8K3M1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh16f2Q8K3M1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rdh16f2Q8K3M1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Rdh16f2Q8K3M1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rdh16f2Q8K3M1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rdh16f2Q8K3M1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rdh16f2Q8K3M1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rdh16f2Q8K3M1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rdh16f2Q8K3M1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rdh16f2Q8K3M1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh16f2Q8K3M1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh16f2Q8K3M1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rdh16f2Q8K3M1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh16f2Q8K3M1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rdh16f2Q8K3M1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh16f2Q8K3M1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rdh16f2Q8K3M1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rdh16f2Q8K3M1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rdh16f2Q8K3M1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh16f2Q8K3M1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh16f2Q8K3M1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh16f2Q8K3M1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rdh16f2Q8K3M1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh16f2Q8K3M1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rdh16f2Q8K3M1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rdh16f2Q8K3M1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh16f2Q8K3M1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh16f2Q8K3M1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rdh16f2Q8K3M1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rdh16f2Q8K3M1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rdh16f2Q8K3M1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms