Protein–RNA interactions for Protein: Q8K299

Scara5, Scavenger receptor class A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scara5Q8K299 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Scara5Q8K299 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Scara5Q8K299 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Scara5Q8K299 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Scara5Q8K299 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Scara5Q8K299 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Scara5Q8K299 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Scara5Q8K299 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scara5Q8K299 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scara5Q8K299 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Scara5Q8K299 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scara5Q8K299 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scara5Q8K299 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scara5Q8K299 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scara5Q8K299 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scara5Q8K299 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Scara5Q8K299 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms