Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Nek9Q8K1R7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Nek9Q8K1R7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nek9Q8K1R7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nek9Q8K1R7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nek9Q8K1R7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nek9Q8K1R7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nek9Q8K1R7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nek9Q8K1R7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Nek9Q8K1R7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nek9Q8K1R7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nek9Q8K1R7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nek9Q8K1R7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Nek9Q8K1R7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nek9Q8K1R7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nek9Q8K1R7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms