Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHG3

Gcc2, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc2Q8CHG3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Gcc2Q8CHG3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Gcc2Q8CHG3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Gcc2Q8CHG3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Gcc2Q8CHG3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC39■■■■□ 3,83
Gcc2Q8CHG3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Gcc2Q8CHG3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC38,98■■■■□ 3,83
Gcc2Q8CHG3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38,98■■■■□ 3,83
Gcc2Q8CHG3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,97■■■■□ 3,83
Gcc2Q8CHG3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC38,95■■■■□ 3,83
Gcc2Q8CHG3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC38,95■■■■□ 3,83
Gcc2Q8CHG3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,94■■■■□ 3,82
Gcc2Q8CHG3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38,94■■■■□ 3,82
Gcc2Q8CHG3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,93■■■■□ 3,82
Gcc2Q8CHG3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC38,92■■■■□ 3,82
Gcc2Q8CHG3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC38,91■■■■□ 3,82
Gcc2Q8CHG3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Gcc2Q8CHG3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38,9■■■■□ 3,82
Gcc2Q8CHG3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,89■■■■□ 3,82
Gcc2Q8CHG3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,88■■■■□ 3,81
Gcc2Q8CHG3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,81
Gcc2Q8CHG3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Gcc2Q8CHG3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Gcc2Q8CHG3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Gcc2Q8CHG3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC38,84■■■■□ 3,81
Gcc2Q8CHG3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,83■■■■□ 3,81
Gcc2Q8CHG3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,81
Gcc2Q8CHG3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,8
Gcc2Q8CHG3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC38,81■■■■□ 3,8
Gcc2Q8CHG3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Gcc2Q8CHG3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC38,8■■■■□ 3,8
Gcc2Q8CHG3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC38,8■■■■□ 3,8
Gcc2Q8CHG3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Gcc2Q8CHG3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38,77■■■■□ 3,8
Gcc2Q8CHG3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Gcc2Q8CHG3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Gcc2Q8CHG3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Gcc2Q8CHG3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Gcc2Q8CHG3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC38,75■■■■□ 3,79
Gcc2Q8CHG3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC38,74■■■■□ 3,79
Gcc2Q8CHG3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38,72■■■■□ 3,79
Gcc2Q8CHG3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC38,72■■■■□ 3,79
Gcc2Q8CHG3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Gcc2Q8CHG3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,67■■■■□ 3,78
Gcc2Q8CHG3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Gcc2Q8CHG3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Gcc2Q8CHG3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Gcc2Q8CHG3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC38,65■■■■□ 3,78
Gcc2Q8CHG3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Gcc2Q8CHG3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,64■■■■□ 3,78
Gcc2Q8CHG3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC38,63■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,62■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC38,61■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC38,61■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC38,6■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC38,58■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC38,58■■■■□ 3,77
Gcc2Q8CHG3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38,57■■■■□ 3,76
Gcc2Q8CHG3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Gcc2Q8CHG3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,57■■■■□ 3,76
Gcc2Q8CHG3 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38,53■■■■□ 3,76
Gcc2Q8CHG3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38,53■■■■□ 3,76
Gcc2Q8CHG3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Gcc2Q8CHG3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC38,51■■■■□ 3,76
Gcc2Q8CHG3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,76
Gcc2Q8CHG3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38,51■■■■□ 3,75
Gcc2Q8CHG3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Gcc2Q8CHG3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC38,49■■■■□ 3,75
Gcc2Q8CHG3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Gcc2Q8CHG3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Gcc2Q8CHG3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38,47■■■■□ 3,75
Gcc2Q8CHG3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC38,45■■■■□ 3,75
Gcc2Q8CHG3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC38,45■■■■□ 3,75
Gcc2Q8CHG3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Gcc2Q8CHG3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38,42■■■■□ 3,74
Gcc2Q8CHG3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC38,42■■■■□ 3,74
Gcc2Q8CHG3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Gcc2Q8CHG3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,38■■■■□ 3,74
Gcc2Q8CHG3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,37■■■■□ 3,73
Gcc2Q8CHG3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC38,36■■■■□ 3,73
Gcc2Q8CHG3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Gcc2Q8CHG3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,36■■■■□ 3,73
Gcc2Q8CHG3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Gcc2Q8CHG3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC38,33■■■■□ 3,73
Gcc2Q8CHG3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,73
Gcc2Q8CHG3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,72
Gcc2Q8CHG3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Gcc2Q8CHG3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC38,3■■■■□ 3,72
Gcc2Q8CHG3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Gcc2Q8CHG3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC38,27■■■■□ 3,72
Gcc2Q8CHG3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Gcc2Q8CHG3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Gcc2Q8CHG3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38,25■■■■□ 3,71
Gcc2Q8CHG3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,24■■■■□ 3,71
Gcc2Q8CHG3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC38,23■■■■□ 3,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms