Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg2bQ80XK6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Atg2bQ80XK6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Atg2bQ80XK6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg2bQ80XK6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Atg2bQ80XK6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Atg2bQ80XK6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg2bQ80XK6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Atg2bQ80XK6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Atg2bQ80XK6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg2bQ80XK6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg2bQ80XK6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg2bQ80XK6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Atg2bQ80XK6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg2bQ80XK6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Atg2bQ80XK6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Atg2bQ80XK6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Atg2bQ80XK6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg2bQ80XK6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg2bQ80XK6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Atg2bQ80XK6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Atg2bQ80XK6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg2bQ80XK6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Atg2bQ80XK6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg2bQ80XK6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Atg2bQ80XK6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg2bQ80XK6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Atg2bQ80XK6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Atg2bQ80XK6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg2bQ80XK6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg2bQ80XK6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg2bQ80XK6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Atg2bQ80XK6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atg2bQ80XK6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg2bQ80XK6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg2bQ80XK6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg2bQ80XK6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg2bQ80XK6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg2bQ80XK6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg2bQ80XK6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg2bQ80XK6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg2bQ80XK6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg2bQ80XK6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg2bQ80XK6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg2bQ80XK6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Atg2bQ80XK6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg2bQ80XK6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Atg2bQ80XK6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg2bQ80XK6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Atg2bQ80XK6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg2bQ80XK6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Atg2bQ80XK6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Atg2bQ80XK6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms