Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Prrc2bQ7TPM1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Prrc2bQ7TPM1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Prrc2bQ7TPM1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Prrc2bQ7TPM1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Prrc2bQ7TPM1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Prrc2bQ7TPM1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Prrc2bQ7TPM1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Prrc2bQ7TPM1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Prrc2bQ7TPM1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Prrc2bQ7TPM1 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Prrc2bQ7TPM1 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Prrc2bQ7TPM1 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Prrc2bQ7TPM1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Prrc2bQ7TPM1 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Prrc2bQ7TPM1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Prrc2bQ7TPM1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Prrc2bQ7TPM1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Prrc2bQ7TPM1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Prrc2bQ7TPM1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Prrc2bQ7TPM1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Prrc2bQ7TPM1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Prrc2bQ7TPM1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Prrc2bQ7TPM1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Prrc2bQ7TPM1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Prrc2bQ7TPM1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Prrc2bQ7TPM1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Prrc2bQ7TPM1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Prrc2bQ7TPM1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Prrc2bQ7TPM1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Prrc2bQ7TPM1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Prrc2bQ7TPM1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Prrc2bQ7TPM1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Prrc2bQ7TPM1 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Prrc2bQ7TPM1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Prrc2bQ7TPM1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Prrc2bQ7TPM1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Prrc2bQ7TPM1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Prrc2bQ7TPM1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Prrc2bQ7TPM1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Prrc2bQ7TPM1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Prrc2bQ7TPM1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Prrc2bQ7TPM1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Prrc2bQ7TPM1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Prrc2bQ7TPM1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Prrc2bQ7TPM1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Prrc2bQ7TPM1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Prrc2bQ7TPM1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Prrc2bQ7TPM1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Prrc2bQ7TPM1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Prrc2bQ7TPM1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Prrc2bQ7TPM1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Prrc2bQ7TPM1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Prrc2bQ7TPM1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Prrc2bQ7TPM1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Prrc2bQ7TPM1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Prrc2bQ7TPM1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Prrc2bQ7TPM1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Prrc2bQ7TPM1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Prrc2bQ7TPM1 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
Prrc2bQ7TPM1 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms