Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC28,48■■■□□ 2,15
Sbf1Q6ZPE2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
Sbf1Q6ZPE2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28,46■■■□□ 2,15
Sbf1Q6ZPE2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Sbf1Q6ZPE2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Sbf1Q6ZPE2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,46■■■□□ 2,15
Sbf1Q6ZPE2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28,45■■■□□ 2,15
Sbf1Q6ZPE2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,15
Sbf1Q6ZPE2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Sbf1Q6ZPE2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Sbf1Q6ZPE2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Sbf1Q6ZPE2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Sbf1Q6ZPE2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
Sbf1Q6ZPE2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28,42■■■□□ 2,14
Sbf1Q6ZPE2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28,4■■■□□ 2,14
Sbf1Q6ZPE2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Sbf1Q6ZPE2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Sbf1Q6ZPE2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Sbf1Q6ZPE2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
Sbf1Q6ZPE2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Sbf1Q6ZPE2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,37■■■□□ 2,13
Sbf1Q6ZPE2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,36■■■□□ 2,13
Sbf1Q6ZPE2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
Sbf1Q6ZPE2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Sbf1Q6ZPE2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Sbf1Q6ZPE2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
Sbf1Q6ZPE2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Sbf1Q6ZPE2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC28,33■■■□□ 2,13
Sbf1Q6ZPE2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,32■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC28,28■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,27■■■□□ 2,12
Sbf1Q6ZPE2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Sbf1Q6ZPE2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,25■■■□□ 2,11
Sbf1Q6ZPE2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Sbf1Q6ZPE2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
Sbf1Q6ZPE2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Sbf1Q6ZPE2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,24■■■□□ 2,11
Sbf1Q6ZPE2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
Sbf1Q6ZPE2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC28,22■■■□□ 2,11
Sbf1Q6ZPE2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Sbf1Q6ZPE2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
Sbf1Q6ZPE2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Sbf1Q6ZPE2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28,18■■■□□ 2,1
Sbf1Q6ZPE2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
Sbf1Q6ZPE2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Sbf1Q6ZPE2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Sbf1Q6ZPE2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28,17■■■□□ 2,1
Sbf1Q6ZPE2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Sbf1Q6ZPE2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28,15■■■□□ 2,1
Sbf1Q6ZPE2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Sbf1Q6ZPE2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,1
Sbf1Q6ZPE2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,14■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28,1■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC28,1■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28,09■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
Sbf1Q6ZPE2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28,07■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,05■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28,04■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Sbf1Q6ZPE2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Sbf1Q6ZPE2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
Sbf1Q6ZPE2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2,07
Sbf1Q6ZPE2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Sbf1Q6ZPE2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Sbf1Q6ZPE2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC27,97■■■□□ 2,07
Sbf1Q6ZPE2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Sbf1Q6ZPE2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,95■■■□□ 2,07
Sbf1Q6ZPE2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Sbf1Q6ZPE2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Sbf1Q6ZPE2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Sbf1Q6ZPE2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Sbf1Q6ZPE2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,92■■■□□ 2,06
Sbf1Q6ZPE2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,92■■■□□ 2,06
Sbf1Q6ZPE2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27,91■■■□□ 2,06
Sbf1Q6ZPE2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Sbf1Q6ZPE2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Sbf1Q6ZPE2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,9■■■□□ 2,06
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