Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
Smarca2Q6DIC0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Smarca2Q6DIC0 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
Smarca2Q6DIC0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Smarca2Q6DIC0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Smarca2Q6DIC0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Smarca2Q6DIC0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Smarca2Q6DIC0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC45.64■■■■■ 4.9
Smarca2Q6DIC0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Smarca2Q6DIC0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
Smarca2Q6DIC0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC45.62■■■■■ 4.89
Smarca2Q6DIC0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
Smarca2Q6DIC0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
Smarca2Q6DIC0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Smarca2Q6DIC0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Smarca2Q6DIC0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC45.58■■■■■ 4.89
Smarca2Q6DIC0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
Smarca2Q6DIC0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
Smarca2Q6DIC0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC45.57■■■■■ 4.89
Smarca2Q6DIC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
Smarca2Q6DIC0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.88
Smarca2Q6DIC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
Smarca2Q6DIC0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Smarca2Q6DIC0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Smarca2Q6DIC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC45.52■■■■■ 4.88
Smarca2Q6DIC0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC45.51■■■■■ 4.88
Smarca2Q6DIC0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC45.51■■■■■ 4.88
Smarca2Q6DIC0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
Smarca2Q6DIC0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC45.5■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC45.45■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.45■■■■■ 4.87
Smarca2Q6DIC0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.44■■■■■ 4.86
Smarca2Q6DIC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
Smarca2Q6DIC0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
Smarca2Q6DIC0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.42■■■■■ 4.86
Smarca2Q6DIC0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
Smarca2Q6DIC0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC45.41■■■■■ 4.86
Smarca2Q6DIC0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
Smarca2Q6DIC0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC45.38■■■■■ 4.86
Smarca2Q6DIC0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.86
Smarca2Q6DIC0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.37■■■■■ 4.85
Smarca2Q6DIC0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Smarca2Q6DIC0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
Smarca2Q6DIC0 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC45.34■■■■■ 4.85
Smarca2Q6DIC0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
Smarca2Q6DIC0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
Smarca2Q6DIC0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
Smarca2Q6DIC0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
Smarca2Q6DIC0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
Smarca2Q6DIC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
Smarca2Q6DIC0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Smarca2Q6DIC0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC45.24■■■■■ 4.83
Smarca2Q6DIC0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
Smarca2Q6DIC0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
Smarca2Q6DIC0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
Smarca2Q6DIC0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Smarca2Q6DIC0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
Smarca2Q6DIC0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC45.17■■■■■ 4.82
Smarca2Q6DIC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
Smarca2Q6DIC0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
Smarca2Q6DIC0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
Smarca2Q6DIC0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC45.09■■■■■ 4.81
Smarca2Q6DIC0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Smarca2Q6DIC0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
Smarca2Q6DIC0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC45.08■■■■■ 4.81
Smarca2Q6DIC0 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
Smarca2Q6DIC0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
Smarca2Q6DIC0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
Smarca2Q6DIC0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
Smarca2Q6DIC0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Smarca2Q6DIC0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
Smarca2Q6DIC0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
Smarca2Q6DIC0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Smarca2Q6DIC0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
Smarca2Q6DIC0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
Smarca2Q6DIC0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
Smarca2Q6DIC0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Smarca2Q6DIC0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC44.97■■■■■ 4.79
Smarca2Q6DIC0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC44.94■■■■■ 4.79
Smarca2Q6DIC0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.94■■■■■ 4.79
Smarca2Q6DIC0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.92■■■■■ 4.78
Smarca2Q6DIC0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC44.9■■■■■ 4.78
Smarca2Q6DIC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.9■■■■■ 4.78
Smarca2Q6DIC0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Smarca2Q6DIC0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC44.88■■■■■ 4.78
Smarca2Q6DIC0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
Smarca2Q6DIC0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC44.88■■■■■ 4.78
Smarca2Q6DIC0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.85■■■■■ 4.77
Smarca2Q6DIC0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Smarca2Q6DIC0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.84■■■■■ 4.77
Smarca2Q6DIC0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC44.83■■■■■ 4.77
Smarca2Q6DIC0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC44.82■■■■■ 4.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms