Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC42.33■■■■■ 4.37
Ccdc18Q640L5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
Ccdc18Q640L5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
Ccdc18Q640L5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Ccdc18Q640L5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Ccdc18Q640L5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
Ccdc18Q640L5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
Ccdc18Q640L5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.35
Ccdc18Q640L5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.25■■■■■ 4.35
Ccdc18Q640L5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Ccdc18Q640L5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Ccdc18Q640L5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Ccdc18Q640L5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Ccdc18Q640L5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Ccdc18Q640L5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Ccdc18Q640L5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
Ccdc18Q640L5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Ccdc18Q640L5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
Ccdc18Q640L5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Ccdc18Q640L5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Ccdc18Q640L5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC42.09■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC42.07■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
Ccdc18Q640L5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
Ccdc18Q640L5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Ccdc18Q640L5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Ccdc18Q640L5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
Ccdc18Q640L5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC42.01■■■■■ 4.32
Ccdc18Q640L5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC42.01■■■■■ 4.31
Ccdc18Q640L5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
Ccdc18Q640L5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Ccdc18Q640L5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Ccdc18Q640L5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
Ccdc18Q640L5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC41.95■■■■■ 4.31
Ccdc18Q640L5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.3
Ccdc18Q640L5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ccdc18Q640L5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
Ccdc18Q640L5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Ccdc18Q640L5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
Ccdc18Q640L5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC41.9■■■■■ 4.3
Ccdc18Q640L5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
Ccdc18Q640L5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC41.88■■■■■ 4.29
Ccdc18Q640L5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
Ccdc18Q640L5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
Ccdc18Q640L5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
Ccdc18Q640L5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.84■■■■■ 4.29
Ccdc18Q640L5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
Ccdc18Q640L5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
Ccdc18Q640L5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ccdc18Q640L5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Ccdc18Q640L5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc18Q640L5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc18Q640L5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Ccdc18Q640L5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
Ccdc18Q640L5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Ccdc18Q640L5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Ccdc18Q640L5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ccdc18Q640L5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Ccdc18Q640L5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Ccdc18Q640L5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ccdc18Q640L5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ccdc18Q640L5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ccdc18Q640L5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
Ccdc18Q640L5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC41.68■■■■■ 4.26
Ccdc18Q640L5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ccdc18Q640L5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
Ccdc18Q640L5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Ccdc18Q640L5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC41.62■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC41.61■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
Ccdc18Q640L5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
Ccdc18Q640L5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
Ccdc18Q640L5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
Ccdc18Q640L5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Ccdc18Q640L5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Ccdc18Q640L5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
Ccdc18Q640L5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
Ccdc18Q640L5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
Ccdc18Q640L5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
Ccdc18Q640L5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
Ccdc18Q640L5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
Ccdc18Q640L5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
Ccdc18Q640L5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
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