Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Samhd1Q60710 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Samhd1Q60710 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Samhd1Q60710 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Samhd1Q60710 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Samhd1Q60710 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Samhd1Q60710 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Samhd1Q60710 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Samhd1Q60710 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Samhd1Q60710 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Samhd1Q60710 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samhd1Q60710 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samhd1Q60710 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samhd1Q60710 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Samhd1Q60710 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Samhd1Q60710 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Samhd1Q60710 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Samhd1Q60710 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Samhd1Q60710 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Samhd1Q60710 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Samhd1Q60710 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Samhd1Q60710 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Samhd1Q60710 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samhd1Q60710 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samhd1Q60710 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Samhd1Q60710 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Samhd1Q60710 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samhd1Q60710 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Samhd1Q60710 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samhd1Q60710 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Samhd1Q60710 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Samhd1Q60710 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Samhd1Q60710 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Samhd1Q60710 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Samhd1Q60710 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Samhd1Q60710 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Samhd1Q60710 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samhd1Q60710 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samhd1Q60710 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Samhd1Q60710 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samhd1Q60710 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Samhd1Q60710 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samhd1Q60710 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samhd1Q60710 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Samhd1Q60710 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Samhd1Q60710 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Samhd1Q60710 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Samhd1Q60710 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samhd1Q60710 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Samhd1Q60710 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samhd1Q60710 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Samhd1Q60710 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Samhd1Q60710 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Samhd1Q60710 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Samhd1Q60710 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms