Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Sik1Q60670 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sik1Q60670 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Sik1Q60670 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sik1Q60670 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sik1Q60670 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Sik1Q60670 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Sik1Q60670 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sik1Q60670 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sik1Q60670 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sik1Q60670 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sik1Q60670 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Sik1Q60670 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sik1Q60670 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sik1Q60670 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Sik1Q60670 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sik1Q60670 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sik1Q60670 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sik1Q60670 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sik1Q60670 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sik1Q60670 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sik1Q60670 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sik1Q60670 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sik1Q60670 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Sik1Q60670 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sik1Q60670 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Sik1Q60670 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sik1Q60670 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sik1Q60670 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sik1Q60670 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sik1Q60670 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sik1Q60670 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Sik1Q60670 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Sik1Q60670 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sik1Q60670 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Sik1Q60670 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sik1Q60670 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Sik1Q60670 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sik1Q60670 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Sik1Q60670 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
Sik1Q60670 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Sik1Q60670 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sik1Q60670 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Sik1Q60670 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Sik1Q60670 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sik1Q60670 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Sik1Q60670 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Sik1Q60670 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sik1Q60670 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Sik1Q60670 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sik1Q60670 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sik1Q60670 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Sik1Q60670 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Sik1Q60670 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sik1Q60670 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sik1Q60670 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sik1Q60670 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Sik1Q60670 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sik1Q60670 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sik1Q60670 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sik1Q60670 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Sik1Q60670 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Sik1Q60670 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sik1Q60670 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sik1Q60670 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Sik1Q60670 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Sik1Q60670 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sik1Q60670 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Sik1Q60670 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sik1Q60670 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sik1Q60670 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Sik1Q60670 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Sik1Q60670 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sik1Q60670 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Sik1Q60670 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sik1Q60670 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Sik1Q60670 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sik1Q60670 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Sik1Q60670 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms