Protein–RNA interactions for Protein: Q5YIR8

Clec4a4, C-type lectin domain family 4, member a4, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a4Q5YIR8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clec4a4Q5YIR8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Clec4a4Q5YIR8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Clec4a4Q5YIR8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Clec4a4Q5YIR8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clec4a4Q5YIR8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4a4Q5YIR8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4a4Q5YIR8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clec4a4Q5YIR8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4a4Q5YIR8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clec4a4Q5YIR8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clec4a4Q5YIR8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clec4a4Q5YIR8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Clec4a4Q5YIR8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clec4a4Q5YIR8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec4a4Q5YIR8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec4a4Q5YIR8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clec4a4Q5YIR8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec4a4Q5YIR8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clec4a4Q5YIR8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clec4a4Q5YIR8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clec4a4Q5YIR8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms