Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl5Q5DTT4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rtl5Q5DTT4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Rtl5Q5DTT4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rtl5Q5DTT4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Rtl5Q5DTT4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Rtl5Q5DTT4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rtl5Q5DTT4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rtl5Q5DTT4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rtl5Q5DTT4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rtl5Q5DTT4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Rtl5Q5DTT4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rtl5Q5DTT4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rtl5Q5DTT4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rtl5Q5DTT4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rtl5Q5DTT4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rtl5Q5DTT4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rtl5Q5DTT4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Rtl5Q5DTT4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Rtl5Q5DTT4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl5Q5DTT4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl5Q5DTT4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Rtl5Q5DTT4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Rtl5Q5DTT4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rtl5Q5DTT4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Rtl5Q5DTT4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rtl5Q5DTT4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Rtl5Q5DTT4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rtl5Q5DTT4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rtl5Q5DTT4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rtl5Q5DTT4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rtl5Q5DTT4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Rtl5Q5DTT4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Rtl5Q5DTT4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
Rtl5Q5DTT4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rtl5Q5DTT4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rtl5Q5DTT4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rtl5Q5DTT4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Rtl5Q5DTT4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Rtl5Q5DTT4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Rtl5Q5DTT4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rtl5Q5DTT4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rtl5Q5DTT4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Rtl5Q5DTT4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Rtl5Q5DTT4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rtl5Q5DTT4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms