Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDNFQ49AH0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDNFQ49AH0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDNFQ49AH0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDNFQ49AH0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDNFQ49AH0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDNFQ49AH0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms