Protein–RNA interactions for Protein: Q499D5

Zfp235, Zinc finger protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp235Q499D5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Zfp235Q499D5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Zfp235Q499D5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp235Q499D5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp235Q499D5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp235Q499D5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp235Q499D5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Zfp235Q499D5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Zfp235Q499D5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp235Q499D5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Zfp235Q499D5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp235Q499D5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Zfp235Q499D5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zfp235Q499D5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zfp235Q499D5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zfp235Q499D5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp235Q499D5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp235Q499D5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp235Q499D5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145 ms