Protein–RNA interactions for Protein: Q497M3

Apobec4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec4Q497M3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apobec4Q497M3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apobec4Q497M3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apobec4Q497M3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apobec4Q497M3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apobec4Q497M3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apobec4Q497M3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apobec4Q497M3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apobec4Q497M3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms