Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gtpbp2Q3UJK4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gtpbp2Q3UJK4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp2Q3UJK4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp2Q3UJK4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp2Q3UJK4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Gtpbp2Q3UJK4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp2Q3UJK4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Gtpbp2Q3UJK4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtpbp2Q3UJK4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gtpbp2Q3UJK4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gtpbp2Q3UJK4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gtpbp2Q3UJK4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp2Q3UJK4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp2Q3UJK4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gtpbp2Q3UJK4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtpbp2Q3UJK4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gtpbp2Q3UJK4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp2Q3UJK4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gtpbp2Q3UJK4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gtpbp2Q3UJK4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gtpbp2Q3UJK4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gtpbp2Q3UJK4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gtpbp2Q3UJK4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp2Q3UJK4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtpbp2Q3UJK4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp2Q3UJK4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp2Q3UJK4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtpbp2Q3UJK4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtpbp2Q3UJK4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtpbp2Q3UJK4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtpbp2Q3UJK4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtpbp2Q3UJK4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtpbp2Q3UJK4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp2Q3UJK4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtpbp2Q3UJK4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtpbp2Q3UJK4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtpbp2Q3UJK4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtpbp2Q3UJK4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtpbp2Q3UJK4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp2Q3UJK4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtpbp2Q3UJK4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtpbp2Q3UJK4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtpbp2Q3UJK4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtpbp2Q3UJK4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtpbp2Q3UJK4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtpbp2Q3UJK4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp2Q3UJK4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gtpbp2Q3UJK4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gtpbp2Q3UJK4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp2Q3UJK4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp2Q3UJK4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp2Q3UJK4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp2Q3UJK4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp2Q3UJK4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp2Q3UJK4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gtpbp2Q3UJK4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms