Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Lmod2Q3UHZ5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Lmod2Q3UHZ5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lmod2Q3UHZ5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Lmod2Q3UHZ5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Lmod2Q3UHZ5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lmod2Q3UHZ5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Lmod2Q3UHZ5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Lmod2Q3UHZ5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Lmod2Q3UHZ5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.77
Lmod2Q3UHZ5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Lmod2Q3UHZ5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Lmod2Q3UHZ5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Lmod2Q3UHZ5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Lmod2Q3UHZ5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Lmod2Q3UHZ5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Lmod2Q3UHZ5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Lmod2Q3UHZ5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Lmod2Q3UHZ5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Lmod2Q3UHZ5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Lmod2Q3UHZ5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Lmod2Q3UHZ5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Lmod2Q3UHZ5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
Lmod2Q3UHZ5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Lmod2Q3UHZ5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Lmod2Q3UHZ5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lmod2Q3UHZ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Lmod2Q3UHZ5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Lmod2Q3UHZ5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Lmod2Q3UHZ5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Lmod2Q3UHZ5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Lmod2Q3UHZ5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
Lmod2Q3UHZ5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
Lmod2Q3UHZ5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Lmod2Q3UHZ5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Lmod2Q3UHZ5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Lmod2Q3UHZ5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Lmod2Q3UHZ5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Lmod2Q3UHZ5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Lmod2Q3UHZ5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
Lmod2Q3UHZ5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Lmod2Q3UHZ5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Lmod2Q3UHZ5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Lmod2Q3UHZ5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Lmod2Q3UHZ5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC38.18■■■■□ 3.7
Lmod2Q3UHZ5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Lmod2Q3UHZ5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Lmod2Q3UHZ5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Lmod2Q3UHZ5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lmod2Q3UHZ5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lmod2Q3UHZ5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Lmod2Q3UHZ5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Lmod2Q3UHZ5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Lmod2Q3UHZ5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Lmod2Q3UHZ5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Lmod2Q3UHZ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Lmod2Q3UHZ5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Lmod2Q3UHZ5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Lmod2Q3UHZ5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Lmod2Q3UHZ5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Lmod2Q3UHZ5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Lmod2Q3UHZ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lmod2Q3UHZ5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
Lmod2Q3UHZ5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Lmod2Q3UHZ5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Lmod2Q3UHZ5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Lmod2Q3UHZ5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Lmod2Q3UHZ5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Lmod2Q3UHZ5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Lmod2Q3UHZ5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Lmod2Q3UHZ5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Lmod2Q3UHZ5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Lmod2Q3UHZ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
Lmod2Q3UHZ5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
Lmod2Q3UHZ5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Lmod2Q3UHZ5 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms