Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK8

Tnrc6a, Trinucleotide repeat-containing gene 6A protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6aQ3UHK8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6aQ3UHK8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tnrc6aQ3UHK8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6aQ3UHK8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6aQ3UHK8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6aQ3UHK8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tnrc6aQ3UHK8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tnrc6aQ3UHK8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6aQ3UHK8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6aQ3UHK8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6aQ3UHK8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6aQ3UHK8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6aQ3UHK8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6aQ3UHK8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6aQ3UHK8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6aQ3UHK8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6aQ3UHK8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6aQ3UHK8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6aQ3UHK8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6aQ3UHK8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6aQ3UHK8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6aQ3UHK8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6aQ3UHK8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Tnrc6aQ3UHK8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6aQ3UHK8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tnrc6aQ3UHK8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Tnrc6aQ3UHK8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tnrc6aQ3UHK8 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tnrc6aQ3UHK8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tnrc6aQ3UHK8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tnrc6aQ3UHK8 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tnrc6aQ3UHK8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6aQ3UHK8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tnrc6aQ3UHK8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tnrc6aQ3UHK8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tnrc6aQ3UHK8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6aQ3UHK8 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6aQ3UHK8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tnrc6aQ3UHK8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tnrc6aQ3UHK8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tnrc6aQ3UHK8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6aQ3UHK8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6aQ3UHK8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6aQ3UHK8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tnrc6aQ3UHK8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tnrc6aQ3UHK8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6aQ3UHK8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tnrc6aQ3UHK8 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms