Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Srebf2Q3U1N2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srebf2Q3U1N2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srebf2Q3U1N2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srebf2Q3U1N2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Srebf2Q3U1N2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Srebf2Q3U1N2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Srebf2Q3U1N2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srebf2Q3U1N2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srebf2Q3U1N2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Srebf2Q3U1N2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Srebf2Q3U1N2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Srebf2Q3U1N2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Srebf2Q3U1N2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Srebf2Q3U1N2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srebf2Q3U1N2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srebf2Q3U1N2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Srebf2Q3U1N2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srebf2Q3U1N2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srebf2Q3U1N2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Srebf2Q3U1N2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Srebf2Q3U1N2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Srebf2Q3U1N2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Srebf2Q3U1N2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srebf2Q3U1N2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srebf2Q3U1N2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Srebf2Q3U1N2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srebf2Q3U1N2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srebf2Q3U1N2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Srebf2Q3U1N2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Srebf2Q3U1N2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Srebf2Q3U1N2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Srebf2Q3U1N2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Srebf2Q3U1N2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Srebf2Q3U1N2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Srebf2Q3U1N2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srebf2Q3U1N2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Srebf2Q3U1N2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Srebf2Q3U1N2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srebf2Q3U1N2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srebf2Q3U1N2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Srebf2Q3U1N2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Srebf2Q3U1N2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Srebf2Q3U1N2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Srebf2Q3U1N2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Srebf2Q3U1N2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms