Protein–RNA interactions for Protein: Q3TY92

Mbd6, Methyl-CpG-binding domain protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd6Q3TY92 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mbd6Q3TY92 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mbd6Q3TY92 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd6Q3TY92 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd6Q3TY92 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd6Q3TY92 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd6Q3TY92 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mbd6Q3TY92 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mbd6Q3TY92 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Mbd6Q3TY92 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mbd6Q3TY92 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Mbd6Q3TY92 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mbd6Q3TY92 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Mbd6Q3TY92 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mbd6Q3TY92 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mbd6Q3TY92 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd6Q3TY92 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd6Q3TY92 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd6Q3TY92 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Mbd6Q3TY92 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Mbd6Q3TY92 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mbd6Q3TY92 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mbd6Q3TY92 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms