Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3TTL0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Q3TTL0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q3TTL0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q3TTL0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Q3TTL0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3TTL0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Q3TTL0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3TTL0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3TTL0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3TTL0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3TTL0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3TTL0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3TTL0 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3TTL0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3TTL0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3TTL0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3TTL0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3TTL0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3TTL0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3TTL0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3TTL0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3TTL0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TTL0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TTL0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TTL0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TTL0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3TTL0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3TTL0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3TTL0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3TTL0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3TTL0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3TTL0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3TTL0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Q3TTL0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3TTL0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q3TTL0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Q3TTL0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Q3TTL0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q3TTL0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q3TTL0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q3TTL0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Q3TTL0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Q3TTL0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3TTL0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Q3TTL0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms